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Laboratorio de Genómica

La secuenciación masiva de ácidos nucleicos es parte importante de muchos proyectos de investigación en diferentes áreas de las Ciencias Biológicas y Médicas; obtener esta información  de forma rápida y con altos estándares de calidad puede representar una limitante para el desarrollo de dichos proyectos

El LANASE cuenta con un secuenciador de próxima generación Illumina NextSeq 550  que permite obtener perfiles de expresión, secuenciación de exomas o genoma completo y  secuenciación de mRNA con altos niveles de cobertura en tiempos cortos una vez que el material está listo para secuenciación. Así mismo el equipo con el que cuenta LANASE ofrece la posibilidad de realizar escaneo de arreglos (microarreglos) realizados utilizados con la tecnología BeadArray de Illumina.

Las secuencias obtenidas mediante el Illumina NextSeq 550 pueden ser ensambladas automáticamente mediante la plataforma nativa del equipo o bien pueden ser extraídas para su procesamiento con otras herramientas informáticas.

NGS
  • Construcción y secuenciación de bibliotecas metabarcoding para estudios de
  • biodiversidad, uso y disponibilidad de recursos genéticos.
  • Genotipificación de abejas melíferas por múltiples amplicones
  • Secuenciación de genomas, transcriptomas, exomas y epigenomas
  • Indexación dual y secuenciación de bibliotecas
PCR en tiempo real y análisis de HRM
  • Identificación de organismos patógenos y no patógenos por qPCR
  • Cuantificación de bibliotecas genómicas y metagenómicas
  • Detección de variantes genéticas y SNPs por HRM
Electroforesis capilar
  • Determinación del tamaño de las bibliotecas genómicas y metagenómicas
  • Detección de variantes genéticas por análisis de fragmentos de ADN
Extracción de Ácidos Nucleicos
  • Extracción de ADN de organismos no-modelo y de muestras ambientales
  • Extracción de RNA tanto de organismos como de muestras ambientales
  • Extracción simultanea de ADN y ARN
Otros Servicios
  • Contador de partículas
  • Captura y análisis de muestras bajo epifluorescencia